Набор SALSA MLPA для детекции ME012 MGMT-IDH1- IDH2. При глиомах
Набор для обнаружения аберрантного метилирования одной или нескольких последовательностей гена MGMT.
Также может быть использован для обнаружения наличия точечных мутаций IDH1 (p.R132H=c.395G>A и p.R132C=c.394C>T) или IDH2 (p.R172K=c.515G>A и p.R172M=c.515G>T).
SALSA MS-MLPA Probemix ME012 MGMT-IDH1-IDH2 содержит 31 (MS-)MLPA зонд с продуктами амплификации между 121 и 317 нуклеотидами (nt). Шесть зондов MS-MLPA содержат сайт распознавания HhaI и предоставляют информацию о статусе метилирования промоутерской области MGMT. Все присутствующие зонды также дают информацию об изменении копий в анализируемом образце. Кроме того, этот микс содержит четыре мутационно-специфических зонда для идентификации четырех наиболее преобладающих точечных мутаций IDH1 (p.R132H и p.R132C) и IDH2 (p.R172K и p.R172M) в глиоме.
Включены 18 эталонных зондов, которые не подвержены влиянию пищеварения HhaI и нацелены на относительно стабильные области в глиоме. Кроме того, два контрольных зонда пищеварения и один контрольный зонд очистки включены в этот микс, указывающий, было ли поглощение эндонуклеазы рестрикции в реакции MS-MLPA полным, и была ли ДНК затронута депуринацией, соответственно. Идентификация генов, обнаруженных эталонными зондами, доступна, а полные последовательности зондов доступны в Интернете (www.mlpa.com).
Этот пробный микс содержит девять фрагментов контроля качества, генерирующих продукты амплификации между 64 и 105 нт: четыре фрагмента количества ДНК (Q-фрагменты), два фрагмента денатурации ДНК (D-фрагменты), один фрагмент Benchmark и один хромосомный X и один хромосомный Y-специфический фрагмент. Более подробную информацию о том, как интерпретировать наблюдения за этими контрольными фрагментами, можно найти в Общем протоколе MS-MLPA и в Интернете по адресу www.mlpa.com.
SALSA Binning DNA SD054: ДНК SD054 Binning, поставляемая с этим пробным миксом, может быть использована для биннинга четырех мутационно-специфических зондов IDH1 probe 19529-L16492 при 203 nt (p.R132H=c.395G>A), IDH1 probe 19926-L29107 при 225 nt (p.R132C=c.394C>T), IDH2 probe 20643-L29002 при 145 nt (p.R172K=c.515G>A) и IDH2 probe 20643-L29001 при 151 нт (p.R172M=c.515G>T). SD054 Биннинг ДНК представляет собой микстуre геномной ДНК здоровых людей и плазмидной ДНК, которая содержит целевую последовательность, обнаруженную вышеупомянутыми зондами. Включение одной реакции с 5 мкл ДНК SD054 Binning в первоначальные эксперименты MLPA имеет важное значение, поскольку оно может быть использовано для помощи в биннинге данных пикового паттерна с использованием программного обеспечения Coffalyser.Net. Кроме того, биннинг ДНК должен быть включен в эксперимент всякий раз, когда изменения были применены к установке устройства капиллярного электрофореза (например, когда капилляры были обновлены). Биннинг ДНК никогда не должен использоваться в качестве эталонного образца в анализе данных MLPA, а также не должен использоваться при количественной оценке сигналов мутации, поскольку для этой цели должны использоваться истинные образцы положительных мутаций / SNP пациентов или клеточные линии. Настоятельно рекомендуется, чтобы все тестируемые образцы извлекались одним и тем же методом и извлекались из одного и того же источника ткани. Для получения более подробной информации, пожалуйста, обратитесь к описанию продукта SD054 Binning DNA, доступному в Интернете: www.mlpa.com.
Информация для заказа
Область использования: | Производство: | --- |
Метод: | |
Объем: | 50 реакций |
Кат. номер: | ME012-050R |
Цена (с НДС 20%): | по запросу | В корзину |
Наименование: Набор SALSA MLPA для детекции ME012 MGMT-IDH1- IDH2. При глиомах. Примечание: |