Главная проблема лабораторий ПЦР
Полимеразная цепная реакция - потрясающе чувствительный метод! Теоретически, вы можете детектировать наличие в образце всего одной копии искомого фрагмента ДНК. Однако данное преимущество оборачивается и не менее значительной проблемой. Главная проблема при функционировании лаборатории ПЦР - контаминация. Контаминация возникает тогда, когда продукты ПЦР (ампликоны) попадают в окружающую среду. Это может происходить по нескольким причинам: вследствие неправильной организации ПЦР-лаборатории, из-за ошибок при постановке полимеразной цепной реакции или детекции результатов ПЦР (человеческий фактор), по причине большого потока исследований. Контаминация может проявляться в ложноположительных результатах ПЦР или возникновении неспецифических продуктов ПЦР.
Перекрестная контаминация от одной пробы к другой может возникать при обработке образцов или в процессе приготовления реакционной смеси. Следствие перекрестной контаминации - спорадические ложноположительные результаты. При несоблюдении мер безопасности с течением времени в лаборатории могут накапливаться ампликоны, что приводит к появлению тотальной контаминации.
Шесть главных правил предотвращения контаминации в лаборатории ПЦР
- отдельные лабораторные халаты в каждой рабочей зоне;
- одноразовые перчатки без талька;
- наконечники для дозаторов с фильтрами, защищающими от аэрозоля
- одноразовые пластиковые пробирки, посуда, наконечники;
- соблюдение поточности продвижения анализируемых образцов;
- химическая и УФ дезинфекция всех поверхностей рабочих зон.
Организация лаборатории ПЦР
|
