Организация ПЦР-лаборатории

• Метод ПЦР
• Требования к организации помещений для лаборатории ПЦР
• Главная проблема лабораторий ПЦР
• Классическая ПЦР-лаборатория
• ПЦР в модификации FLASH
• Расходные материалы в ПЦР-лаборатории
• Мобильная лаборатория
• Нормативно-правовые документы по ПЦР

Специфика ПЦР-лабораторий

Компания Лабораторная Диагностика специализируется на комплексном оснащении ПЦР-лабораторий в России с 1997 года. Мы обладаем уникальным многолетним опытом создания лабораторий ПЦР «под ключ». Наши специалисты готовы ответить на любые ваши вопросы по ПЦР-диагностике, оборудованию, реагентам, расходным материалам, требованиям и нормам организации современных ПЦР лабораторий.

Организация ПЦР-лаборатории требует тщательной подготовительной работы. Необходимо заранее определить, какие именно задачи предстоит решать в лаборатории. Помимо этого важно понимать, какими методами будут достигнуты поставленные задачи.

Области использования различных методов ПЦР

 * - условное значение, т.к. анализ занимает более одного дня. 

 В основу функционирования ПЦР-лаборатории могут быть заложены три основных метода:

• Классическая полимеразная цепная реакция (ПЦР с электрофоретической детекцией).
• ПЦР в режиме «реального времени» (Real-time PCR).
• ПЦР с флуоресцентной детекцией по «конечной точке» (FLASH).

Стоит заметить, что в ПЦР-лаборатории, при соответствующем оснащении, можно использовать и другие методы:

• секвенирование по Сэнгеру;
• высокопроизводительное секвенирование (пиросеквенирование);
• гибридизационные микрочипы высокой плотности;
• микрофлуидальные чипы;
• мультиплексный анализ.

Выбор метода повлияет на общую стоимость проекта оснащения лаборатории. Помимо типа ПЦР-лаборатории, не менее важно определить приблизительный пробопоток вашей будущей лаборатории. Какое количество анализов/тестов/реакций вы планируете выполнять в день/неделю/месяц в лаборатории? Исходя из ожидаемого количества, можно заранее определить количество сотрудников/операторов, которые будут проводить реакции в лаборатории.  

Параллельно с выбором оборудования следует совершить не менее важный шаг – осмотреть помещение, где планируется организовать лабораторию. Подробную информацию вы можете найти в разделе "Требования к организации помещений для лаборатории ПЦР". Здесь же сообщим некоторые принципиальные моменты:

• во-первых, рабочих зон должно быть не менее двух;
• во-вторых, обязательны приточно-вытяжная вентиляция, водоснабжение, электрообеспечение помещений, системы пожаротушения;
• в-третьих, зона детекции продуктов амплификации методом электрофореза должна быть максимально удалена от зон выделения ДНК/РНК и приготовления смеси реакции;
• в-четвертых, размер помещений зависит от количества сотрудников в лаборатории, но рекомендации могут быть следующие: площадь зоны выделения нуклеиновых кислот = 15-20 кв.м., площадь зоны приготовления реакционное смеси = 15-20 кв.м., площадь зоны детекции = 25-30 кв.м;
• в-пятых, лабораторная мебель должна обеспечивать удобство работы (столы по периметру помещения, шкафы, полки, тумбочки, стулья).

Частные методические и организационные вопросы

1. Каким способом выделять нуклеиновые кислоты?

В данном разделе обсуждаем принципиальный вопрос: как вы будете выделять нуклеиновые кислоты из образцов? Варианта два – ручным методом с помощью готовых наборов, либо с помощью автоматических экстракторов.

Ручной метод дешевле. В этом главное преимущество. Недостатков несколько: более длительная процедура, меньшее количество образцов можно выделить за день, колебания в качестве и количестве выделяемой ДНК/РНК, зависимость от оператора. Автомат позволяет высвободить рабочие руки оператора для другой работы, стандартизирует качество и количество выделения НК, сокращает время выделения, увеличивает количество выделяемых образцов за рабочий день/смену. Главный недостаток: более высокая стоимость выделения одного образца.

Как правило, на начальном этапе существования лаборатории выделяют ручным методом. При увеличении пробопотока в ПЦР-лаборатории начинают использовать экстрактор нуклеиновых кислот.

2. Как обеззараживать образцы и пробирки ПЦР?

Многие ПЦР-лаборатории имеют дело с образцами, которые необходимо проанализировать на наличие ДНК/РНК возбудителя инфекционных заболеваний. Существуют разные требования безопасности при работе с патогенами III-IV группы и с микроорганизмами I-II групп патогенности. Для подробного знакомства с данным вопросом рекомендуется изучить раздел "Нормативно-правовые документы".

Все отходы, возникающие в процессе ПЦР, подвергаются обязательному химическому (гиппохлорид) и термическому (стерилизация) обеззараживанию.

Организация лаборатории ПЦР

• Метод ПЦР
• Требования к организации помещений для лаборатории ПЦР
• Главная проблема лабораторий ПЦР
• Классическая ПЦР-лаборатория
• ПЦР в модификации FLASH
• Расходные материалы в ПЦР-лаборатории
• Нормативно-правовые документы по ПЦР