Изучение взаимодействий белок-белок и ДНК-белок
Белок-белковые взаимодействия составляют основу интерактома любой живой клетки. Они участвуют в таких важных клеточных процессах, как передача сигнала, клеточное общение, транскрипция, репликация, мембранный транспорт и другие.
Белок-белковые взаимодействия рассматриваются со стороны биохимии, квантовой химии, молекулярной динамики, передачи сигналов в клетке. Полученная информация позволяет создавать обширные сети белковых взаимодействий, похожих на метаболические или генетические/эпигенетические связи. Это расширяет текущие знания о биохимических каскадах и патогенезе заболеваний, а также открывает новые возможности для поиска новых терапевтических мишеней.
ДНК-связывающие белки - это белки, которые образованы с ДНК-связывающих доменов, а следовательно имеют специфическую или общую сродство к одно- или двухниточных ДНК.
Конечно, гидрофобных взаимодействий белок и ДНК образуют больше, чем полярных связей, что связано прежде всего с большим количеством гиброфобных атомов (прежде всего атомов углерода) по сравнению с полярными атомами (кислорода и азота). |