Наборы для определения мутаций онкогенов методом NGS

Набор AmoyDx HANDLE HRR NGS Panel

Панель AmoyDx HANDLE HRR NGS (Reversible Terminator Sequencing), предназначена для качественного обнаружения AR, ATM, ATR, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK12, CHEK1, CHEK2, ESR1, FANCA, FANCL, HDAC2, HOXB13 , MRE11A, NBN, PALB2, PPP2R2A, PTEN, RAD51B, варианты RAD51C, RAD51D, RAD54L, STK11 и TP53 (в кодирующих экзонах и границах экзон-интрон) и горячие точки генов BRAF, ERBB2, KRAS, NRAS и PIK3CA в ДНК, выделенной из ДНК в PIK3CA образцы человеческой крови, свежие ткани или нейтральные фиксированные формалином образцы с парафиновой заливкой (FFPE). Обнаруженные варианты включают точечные мутации, небольшие вставки и делеции в генах HRR.

Набор AmoyDx HRD Focus Panel 

Процесс репарации ДНК путем гомологичной рекомбинации (ГР) (англ. homologous recombination repair, HRR) играет важную роль при разрыве двойной цепи ДНК, которая является основной причиной развития рака (1-5). Показано, что потеря функции генов HRR (например, BRCA1, BRCA2, PALB2) и нарушение гомологичной рекомбинации (англ. Homologous Recombination Deficiency, HRD) повышает риск развития раковых заболеваний, а пациенты с мутациями генов HRR лучше реагируют на ингибиторы поли (АДФ-рибоза)-полимеразы (PARP-ингибиторы или просто PARPi) и терапию на основе препаратов платины (6-7). Тестирование на наличие HRD и мутаций BRCA1/2 было одобрено для отбора пациентов для терапии PARPi.

Набор AmoyDx Handle Classic NGS Panel

для определения статуса мутаций в 32 онкогенах

Набор HANDLE Classic оптимально использовать для первого анализа образца методом NGS:

• Быстрота –5 часов длительность рабочего цикла
• Простота – весь протокол выполняется в одной пробирке
• Чувствительность и точность
• Большое покрытие мутаций в генах
• Меньшее количество генерируемых данных –меньше стоимость
• Тканевые образца (РНК)
• Подходит для определения известных фьюжен–генов (РНК)

Набор AmoyDx Essential NGS Panel

для определения статуса мутаций в 10 онкогенах

Набор ddCAP (Essential NGS Panel) рекомендуется для случаев, когда необходимо получить информацию о большем количестве генов или требуется проанализировать образец жидкой биопсии:

• Более высокая чувствительность (до 0,2%)
• Точность
• Большее количество генов
• Образцы жидкой биопсии
• Подходит для определения неизвестных фьюжен–генов (ДНК)

Набор AmoyDx Comprehensive Panel

Панель AmoyDx Comprehensive Panel предназначена для качественного обнаружения однонуклеотидных вариантов (SNV), вставок и делеций (indels), фьюжен-генов и вариаций числа копий (CNV) в 110 генах, однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в 19 генах и определения статуса микросателлитной нестабильности опухоли (MSI) методом NGS. Данный набор позволяет обнаруживать SNV, Indels, фьюжен-гены, CNV, SNP и MSI в ДНК, выделенной из парафиновых блоков FFPE, а также обнаружение SNV, indels, фьюжен-генов и SNP в циркулирующей ДНК (цДНК), выделенной из плазмы, полученной из образцов цельной периферической крови с антикоагулянтом.

Набор для определения мутаций в генах BRCA1 и BRCA2 методом NGS

Набор AmoyDx BRCA1 и BRCA2 Gene Mutation Detection Kit (секвенирование путем синтеза) предназначен для качественного определения мутаций в генах BRCA1 и BRCA2 (включая все кодирующие экзоны, границы экзон-интрон) в образцах ДНК человека, выделенной из крови, свежих образцов ткани и нейтральных парафиновых  блоков тканей (FFPE). Набор предназначен для определения статуса мутаций BRCA1 и BRCA2 у пациентов с раком яичников и раком груди.

Наименование	Объем	Производство	Метод	Кат.Номер
AmoyDx® BRCA Pro Panel RUO	24	AmoyDx	NGS	8.06.0117
AmoyDx® Comprehensive Panel	24	AmoyDx	NGS	8.06.0113
AmoyDx® Essential NGS Panel	24	AmoyDx	NGS	8.06.0002
AmoyDx® Essential NGS Panel RUO	24	AmoyDx	NGS	8.06.0004
AmoyDx® HANDLE HRR NGS Panel RUO	24	AmoyDx	NGS	8.06.0016
AmoyDx® HRD Focus Panel RUO	20	AmoyDx	NGS	8.06.0045
AmoyDx® HANDLE Classic NGS Panel	24	AmoyDx	NGS	8.06.0020
AmoyDx® HANDLE Classic NGS Panel RUO	24	AmoyDx	NGS	8.06.0027
AmoyDx® Myeloid Blood Cancer Panel	24	AmoyDx	NGS	8.06.0082
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set B (96 образцов, 12-plex)		Illumina		20077595
Набор AmoyDx HANDLE Classic NGS Panel	24	AmoyDx	NGS	8.0680601X024I
Набор AmoyDx OncoPro Liquid NGS panel	24	AmoyDx	NGS	8.06.0150
Набор AmoyDx® BRCA Pro Panel	24	AmoyDx	NGS	8.06.0104
Набор AmoyDx® Comprehensive Panel	24	AmoyDx	NGS	8.0682501X024I
Набор AmoyDx® HRD Focus Panel , 20	20	AmoyDx	NGS	8.06.0047
Набор AmoyDx® HRD Focus Panel	20	AmoyDx	NGS	8.0683101X024I
Набор AmoyDx® HANDLE Classic NGS Panel	24	AmoyDx	NGS	8.06.0020
Набор Essential NGS Panel	24	AmoyDx	NGS	8.06.27401X024I
Набор для исследования генов восстановления гомологичной рекомбинации AmoyDx HANDLE HRR NGS Panel	24	AmoyDx	NGS	8.0680701X024I
Набор для определения мутаций в генах BRCA1 и BRCA2 методом NGS	24	AmoyDx	NGS	8.06.27203X024I